全自動頂空進樣器樣本準備簡單方便，能有效地避免一些高沸點基質對于質譜的污染以及液體進樣前處理的多過程誤差累積。對于一些揮發性組分以及半揮發性組分靈敏度較好，能得到穩定可靠地定性定量結果。
對于一些含量較低，低揮發性的組分來說，固相微萃取技術能有效的起到一個富集的作用。而頂空（固相微萃取）技術的不足在于檢測范圍較窄，檢測周期較長，定量檢測的準確度不高。
全自動頂空進樣器頂部空間分析是分析頂空樣品瓶中存在的氣體。而用于頂部空間分析的實驗室瓶子，我們稱之為頂空瓶。這種實驗的本質就是揮發性樣品經過加熱揮發氣化后在樣品瓶頂部的空間形成氣體然后擴散，后使氣相色譜瓶中在揮發性樣品之上的頂部氣體進入氣相檢測。
為了達到好的性能與頂空GC，小心要注意樣品制備和儀器設置。瓶和蓋是一個非常重要的，經常被忽視，也要為元素頂部空間分析做好準備。重要的是要確保使用正確的瓶和蓋。
頂空瓶有圓底或者平底倆種區別。這兩種類型都合適與進樣但圓底瓶往往在儲存采樣方面更強。所以工作更可靠的應該是圓底瓶的自動進樣器。圓底瓶也往往承受更高的壓力和更適合的溫度升高和衍生化等應用程序的兼容。
進樣瓶應該清潔。并非所有的瓶是可以標準使用的，骯臟的或反復使用的樣品瓶，可能引起鬼峰或錯誤的檢測結果。在檢測揮發物或者半揮發性混合物沸點比較高的的時候，我們需要加熱才能使物質氣化在頂部。在這一過程中由于其液體（固或固液共存）樣品處于底部位置，所以終就可以在不觸碰樣品瓶內液體的情況下測量到頂部氣體中的物質。
